该研究所设有消化病实验室、内窥镜室、肝病治疗室及胃肠动力检查室，配备有超低温冰箱、低温震荡器、智能放免Y测早仪、酶标仪等实验室系列先进检测仪器和电子胃肠镜、微波治疗卡、24小时PH值动态测试仪、腹水浓缩回输机、14C-液体闪烁计数率仪、四导智能胃肠电图仪、肝病治疗仪等先进设备。
研究所在治疗消化系统炎症、肿瘤、溃疡及功能性疾病方面具有较丰富的临床经验，抢救了许多重症胰腺炎、肝功能衰竭、消化道大出血、顽固性腹水、肝性脑病等危重疑难病人。开展了肝穿刺活检术、食道狭窄扩张术、食道静脉曲张硬化剂治疗、腹水浓缩自体回输术。同时还开展肝动脉栓塞化疗、脾亢脾动脉栓塞术、选择性腹腔血管造影介入等治疗，提高了病人的治愈率及生存率，取得了良好的社会效益。
